Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm3Q08189 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms