Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnn2Q08093 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms