Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CbfbQ08024 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CbfbQ08024 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms