Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AmbpQ07456 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AmbpQ07456 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms