Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nfe2Q07279 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nfe2Q07279 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms