Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah1bQ06985 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah1bQ06985 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms