Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sh3bp2Q06649 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp2Q06649 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms