Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Prrx2Q06348 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Prrx2Q06348 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms