Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Thbs3Q05895 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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