Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox8Q04886 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sox8Q04886 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms