Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CkbQ04447 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CkbQ04447 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms