Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scg2Q03517 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Scg2Q03517 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms