Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Thbs2Q03350 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs2Q03350 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms