Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms