Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfiaQ02780 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfiaQ02780 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms