Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GscQ02591 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GscQ02591 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GscQ02591 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GscQ02591 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GscQ02591 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GscQ02591 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms