Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Muc1Q02496 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms