Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Snai1Q02085 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms