Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna1cQ01815 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1cQ01815 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms