Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HmgcrQ01237 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms