Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gja5Q01231 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms