Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Grin2bQ01097 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms