Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pde1bQ01065 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms