Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms