Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga4Q00651 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms