Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8a1Q00558 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms