Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabpb1Q00420 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms