Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Pax8Q00288 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms