Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gbp10Q000W5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms