Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx2P97474 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx2P97474 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx2P97474 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pitx2P97474 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms