Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tarbp2P97473 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms