Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cmklr1P97468 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmklr1P97468 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms