Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms