Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Arf1P84078 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Arf1P84078 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Arf1P84078 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Arf1P84078 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Arf1P84078 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms