Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SgcdP82347 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SgcdP82347 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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