Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp8a1P70704 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8a1P70704 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms