Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad1P70340 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad1P70340 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms