Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbx6P70327 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms