Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp7P70280 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms