Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd13P70217 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms