Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Traf6P70196 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms