Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkacbP68181 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkacbP68181 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms