Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps17P63276 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps17P63276 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms