Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Kcnab1P63143 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnab1P63143 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms