Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rab1AP62821 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab1AP62821 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms