Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hpcal1P62748 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpcal1P62748 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms