Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpl18aP62717 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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