Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm6P62313 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm6P62313 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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