Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg6P61406 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg6P61406 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms