Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psme3P61290 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms